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研究員 | 林仲彥

Research Grants

與院內合作之計畫

資訊所

編號	年度	計劃名稱	主持人	協同主持人	類別
1	2022/01	開發運用人工智慧篩選可降解新興環境有機污染物如阻燃劑微生物之新穎技術(林仲彥)	林仲彥		學術研究與人才培育
2	2021/01–2021/12	病毒現形高手：上呼吸道致病原之基因型智慧分群(林仲彥)	林仲彥		一般學術研究及評議
3	2021/01–2021/12	開發運用人工智慧篩選可降解新興環境有機污染物如阻燃劑微生物之新穎技術(林仲彥)	林仲彥		一般學術研究及評議
4	2020/01–2020/12	運用多維體學策略來解析環境微生物與有機污染物如阻燃劑之動態降解機制	林仲彥		主題研究與人才培育
5	2020/01–2020/12	病毒現形高手：上呼吸道致病原之基因型智慧分群	林仲彥		主題研究與人才培育
6	2019/01–2020/12	運用多維體學策略來解析環境微生物與有機污染物如阻燃劑之動態降解機制	林仲彥		主題研究與人才培育
7	2018/01–2020/12	間歇性斷食、微生物相及神經發炎反應在帕金森氏症的互動關係	林仲彥		主題研究與人才培育
8	2018/01–2018/12	資料科學研究計畫(林仲彥)	林仲彥		主題研究與人才培育
9	2017/05–2017/12	資料科學種子研究計畫-新世代高通量生物學的雲端分析工具(林仲彥)	林仲彥		主題研究與人才培育
10	2017/01–2017/12	整合多維體策略來解析鋸齒狀腺瘤.大腸癌腺瘤及大腸癌患者腸道菌之基因體組成與宿主間的互動關係	林仲彥		主題研究與人才培育
11	2016/07–2016/12	創新性研究計畫-林仲彥	林仲彥		主題研究與人才培育
12	2014/01–2014/12	龍膽石斑全基因體定序解析早期發育及病源感染後之基因表現受基因體與表觀遺傳基因體的調控機制	林仲彥		主題研究與人才培育

與院外合作之計畫

資訊所

編號	起迄年月	計劃編號	計劃名稱	主持人	協同主持人	補助單位
1	2022/08–2023/07	NSTC111-2314-B-001-004	探討急性肺損傷之精準幹細胞治療策略與臨床應用: 肺部微環境修復之分子與細胞圖譜及其作用機制－建構多維體資料核心解析以臨床級胎盤間葉幹細胞治療肺損傷之免疫微環境變化(2/3)	林仲彥		國家科學及技術委員會
2	2022/08–2023/07	MOST111-2311-B-001-025	以人工智慧加速新型抗生素之精準設計與驗證應用	林仲彥		國家科學及技術委員會
3	2021/08–2022/07	MOST110-2311-B-001-020	以人工智慧來進行抗微生物?的快速鑑別及新型抗生素之設計並建構線上預測平台	林仲彥		國家科學及技術委員會
4	2021/08–2022/07	MOST110-2314-B-001-006	探討急性肺損傷之精準幹細胞治療策略與臨床應用: 肺部微環境修復之分子與細胞圖譜及其作用機制－建構多維體資料核心解析以臨床級胎盤間葉幹細胞治療肺損傷之免疫微環境變化(1/3)	林仲彥		國家科學及技術委員會
5	2020/08–2021/07	MOST109-2314-B-001-012	標靶B型肝炎誘發之肝癌腫瘤生成與Sorafenib抗藥性之微環境：聚焦發炎激素與癌幹細胞特性之轉譯精準醫學研究與臨床意義－以多維體策略來全面解析B型肝炎誘發之肝癌腫瘤生成與造成Sorafenib抗藥性產生之微環境變化(3/3)	林仲彥		國家科學及技術委員會
6	2020/08–2021/07	MOST109-2311-B-001-024	建立人工智慧抗菌肽的快速鑑別及新穎設計之方法並建構線上預測平台	林仲彥		國家科學及技術委員會
7	2020/03–2020/12	109農科-1.2.2-漁-F4	臺灣沿近海帶魚漁業資源管理研究	林仲彥		行政院農業委員會
8	2020/01–2020/12	109農科-12.3.1-科-a2	建構台灣鯛基因體育種分析整合平台以應用於抗病台灣鯛分子標誌輔助選育	林仲彥		行政院農業委員會
9	2019/10–2020/09	MOST108-2321-B-002-071	日本鰻人工繁殖之關鍵技術開發與整合-以高成長、性別決定和良好激素反應相關之基因標誌建立日本鰻種鰻篩選技術	林仲彥		國家科學及技術委員會
10	2019/08–2020/07	108-2314-B-001-002	標靶B型肝炎誘發之肝癌腫瘤生成與Sorafenib抗藥性之微環境：聚焦發炎激素與癌幹細胞特性之轉譯精準醫學研究與臨床意義－以多維體策略來全面解析B型肝炎誘發之肝癌腫瘤生成與造成Sorafenib抗藥性產生之微環境變化(2/3)	林仲彥		國家科學及技術委員會
11	2019/07–2020/02	108-2813-C-001-002-E	108年度大專學生研究計畫-林子棠	林仲彥		國家科學及技術委員會
12	2019/01–2019/12	108農科-14.3.1-科-a2	建構台灣鯛基因體育種分析整合平台以應用於抗病台灣鯛分子標誌輔助選育	林仲彥		行政院農業委員會
13	2018/08–2019/07	MOST107-2314-B-001-002	標靶B型肝炎誘發之肝癌腫瘤生成與Sorafenib抗藥性之微環境：聚焦發炎激素與癌幹細胞特性之轉譯精準醫學研究與臨床意義－以多維體策略來全面解析B型肝炎誘發之肝癌腫瘤生成與造成Sorafenib抗藥性產生之微環境變化(1/3)	林仲彥		國家科學及技術委員會
14	2018/07–2019/06	MOST107-2321-B-002-057	日本鰻人工繁殖之關鍵技術開發與整合-日本鰻人工繁殖之關鍵技術開發與整合	林仲彥		國家科學及技術委員會
15	2018/01–2018/12	107農科-15.1.2-科-a1	高經濟水產基因體生物資訊產業應用平台	林仲彥		行政院農業委員會
16	2017/08–2018/07	MOST106-2313-B-001-010	日本鰻全基因體重組、結構解析與大數據基因資料平台之建置以鑑別重要經濟性狀基因體育種之關鍵因子	林仲彥		國家科學及技術委員會
17	2017/01–2017/12	106農科-19.1.2-科-a1	高經濟水產基因體生物資訊產業應用平台	林仲彥		行政院農業委員會
18	2015/05–2017/12	05T-1030828-2C	多維體學線上分析系統合作研究計畫第二期-KEGG程式銜接	林仲彥		威建股份有限公司
19	2015/01	5426	創新轉譯農學計畫	林仲彥		中央研究院
20	2014/09–2017/12	05T-1030828-1C	多維體學線上分析系統合作研究計畫	林仲彥		威建股份有限公司
21	2014/08–2017/10	MOST103-2311-B-001-033-MY3	以多維體學策略來解析日本鰻全生活史之分子調控機制並建置線上分析資料庫	林仲彥		國家科學及技術委員會
22	2011/08–2014/10	NSC100-2628-E-001-007-MY3	以系統生物學策略來解析與驗證感染過程中病毒與宿主間的交互作用	林仲彥		國科會
23	2010/08–2011/10	NSC99-2628-E-001-016	建構以開放源碼為基礎的實驗室電子記錄本	林仲彥		國科會
24	2010/01–2011/03	NSC99-2321-B-001-025	非模式物種高通量定序資料之整合式生物資訊服務平台	何建明	林仲彥	國科會
25	2009/08–2010/10	NSC98-2221-E-001-018	建構以開放源碼為基礎的實驗室電子紀錄本	林仲彥		國科會
26	2008/12–2009/11	NSC97-2312-B-001-006	非模式物種高通量定序資料之整合式生物資訊服務平台	何建明	林仲彥	國科會
27	2007/05–2008/07	NSC96-3112-B-001-002	以系統生物學手法解析與人類癌症及傳染性疾病相關之蛋白質交互作用網路（3/3）	林仲彥		國科會
28	2006/05–2007/06	NSC95-3112-B-001-003	以系統生物學手法解析與人類癌症及傳染性疾病相關之蛋白質交互作用網路（2/3）	林仲彥		國科會
29	2005/05–2006/07	NSC94-3112-B-001-026	以系統生物學手法解析與人類癌症及傳染性疾病相關之蛋白質交互作用網路（1/3）	林仲彥		國科會

其他合作計畫

編號	起迄年月	計劃名稱	主持人	協同主持人	補助單位
1	2010/08–2012/12	Random mutation on Hepatitis C Virus Genome by High-Resolution Functional Profiling	Ren Sun, Ting-Ting Wu, and Chung-Yen Lin		NIH
2	2011/08–2014/07	Discovery of Recurrent gene fusions in luminal type of Breast Cancer using RNA-seq	Yen Sun Lu, Su-Fang Lin	Chung-Yen Lin	NRPB, MOST
3	2012/03–2016/07	Regenerative mechanism of earthworm	Chun-Hung Chen	Chung-Yen Lin	MOST
4	2011/08–2013/07	Systematic identification of viral-host interactions that regulate MHV-68 replication using multiple approaches	Ren Sun, Ting-Ting Wu and Chung-Yen Lin		NIH, MOST
5	2010/08–2014/07	Penaeid Genome Study in high throughput sequencing	Chu-Fang Lo, Shu-Hwa Chen, Jan-Ming Ho, Chung-Yen Lin		MOST
6	2010/08–2012/07	Microbial diversity of gastrointestinal tracks in flying squirrel	Hung-Tseng Yu	Chung-Yen Lin	MOST
7	2011/10–2013/10	Genome ‐ wide DNA methylation on Cloud: Precise Mapping for Reduced Representation Bisulfite Sequencing ( RRBS ) and Paired ‐ end reads	Chung-Yen Lin		Microsoft Inc (World Could Research)
8	2011/08–2017/07	Taiwan Bioinformatics Institute Core Facility Program project	I-Sho Chang, Chao Hsiung	Chung-Yen Lin	MOST
9	2013/01–2017/12	Assembly and Analytic Cloud Platform for Non-model Genomes	Jan-Ming Ho, Chung-Yen Lin		IIS
10	2011/10–2013/10	Electronic Laboratory Notebook ( Elegance ) for Biomedical Research Community on Sharing, Co - working and Inspiriting in the Cloud	Chung-Yen Lin		Microsoft Inc (World Cloud Research)
11	2015/08–2018/07	Construct Anguilla Transcriptome and Implement web database	Yu-Shan Han	Chung-Yen Lin	MOST
12	2014/08–2017/08	Regenerative mechanism of earthworm	Jun-Hung Chen	Chung-Yen Lin	MOST